ДНК
Биоинформатика
Инфекции
Метагеномика
Расшифровка анализа
Программа для обработки результатов анализа бактериальной ДНК
  • 25 тысяч бактериальных групп
    содержит база данных, на основе которой проводит обработку данных Antimicro
  • До 4 часов
    нужно программе ученых СПбГУ, чтобы расшифровать данные одного полногеномного секвенирования (анализа всей ДНК микроорганизмов)
  • 300 тысяч рублей
    в год будет стоить обработка 100 полногеномных секвенирований (анализа всей ДНК микроорганизмов)
  • На основе базы данных метагенома россиян
    проводит анализ Antimicro. Такая база была создана самостоятельно разработчиками СПбГУ впервые в мире

О проекте

Специалисты СПбГУ создали Antimicro — программу для обработки результатов анализа ДНК микроорганизмов в биоматериалах. В отличие от существующих аналогов, она выполнена полностью на русском языке, недорого стоит, а главное — выдает намного более точный результат. Ведь Antimicro единственная в мире учитывает особенности микробиома россиян.

В настоящее время метагеномное секвенирование (анализ микробного сообщества на основе определения выделенной из образца последовательности ДНК) проводят в сложных клинических случаях. Оперативная обработка результатов метагеномного секвенирования — довольно популярный запрос, а используемые для этого программы имеют ряд недостатков. Ученые СПбГУ решили создать новый продукт, который был бы лишен минусов существующих аналогов.

Так появилась Antimicro. Она обрабатывает загруженную пользователем информацию, а затем формирует заключение. В нем отражается, сколько бактерий и каких видов содержится в образце, а также какой у них уровень антибиотикорезистентности. За счет удобства, невысокой цены, сравнимой производительности, а также уникальной базы данных микробиома россиян у Antimicro есть шанс заменить собой все зарубежные аналоги.

Программу можно будет использовать во многих медицинских направлениях. Она станет полезна для инфекционистов, эпидемиологов, дерматологов, иммунологов, гастроэнтерологов, гинекологов, пульмонологов и даже онкологов. Благодаря Antimicro у врачей появится возможность спасать больше жизней и уменьшать проявления тяжелых хронических заболеваний, связанных с изменениями в микробиоме и приводящих к инвалидизации. Это поможет сохранить работоспособность большего количества людей и положительно скажется на экономической сфере России. Также программа найдет применение в фармакологии, экологии, биотехнологии, сельском хозяйстве и пищевой промышленности.
Преимущества
  • Разнообразие функций
    Помимо основного модуля для обработки данных, в Antimicro есть справочники лекарств и микроорганизмов

  • Своя база данных
    Antimicro проводит анализ, учитывая популяционные отличия микробиома жителей России от микробиома граждан других стран
  • Безопасность
    Программа работает в закрытом контуре, что не позволяет использовать данные россиян в не медицинских целях
  • Курс на сертификат
    Разработчики Antimicro нацелены зарегистрировать разработку как медицинское изделие в Министерстве здравоохранения РФ
  • Недорогая
    Аntimicro намного дешевле своих конкурентов, так как цена на ее использование формируется в зависимости от количества анализируемых образцов в год
  • Удобная
    Для работы программы не нужны большие технологические мощности. Подойдет современный стационарный компьютер
  • Индивидуальный подход
    Для каждого заказчика разработчики соберут свой «пакет» дополнительных модулей и максимально подстроят программу под выполняемые задачи
  • Обеспечить независимость
    Разработка ученых СПбГУ поможет России получить технологический суверенитет в области обработки бактериального метагенома
  • Для российской среды
    Весь интерфейс Antimicro на русском языке, тогда как все аналоги на иностранных языках
  • Простота
    В Antimicro включена инструкция по применению, поэтому в ее работе сможет разобраться даже неопытный пользователь
  • На связи
    У Antimicro оперативный отдел технической поддержки. Его сотрудники смогут быстро ответить на любой вопрос
Пользователи
Лаборатории, предоставляющие услуги по молекулярной диагностике и метагеномному анализу, медицинские центры, научно-исследовательские институты и университеты.
Цели

Создать удобный инструмент для российского медицинского и научного сообщества с целью расшифровки анализа ДНК микроорганизмов в биологических материалах.

Выгоды
Врачи получат простую и недорогую программу для обработки данных метагеномного секвенирования, что позволит им спасать больше людей, а пациенты — оперативное назначение прицельной терапии.

Команда
  • Павел Александрович Сучко

    капитан команды, специалист в области лабораторной диагностики и биотехнологий, обучающийся 1-го курса магистратуры СПбГУ (программа «Биология»), биотехнолог центра геномных технологий «Сербалаб»

  • Лаврентий Глебович Данилов

    продакт-менеджер, кандидат биологических наук, младший научный сотрудник СПбГУ (кафедра генетики и биотехнологий), руководитель направления биоинформатики центра геномных технологий «Сербалаб»

  • Дарья Алексеевна Некрасова

    ведущий биоинформатик, кандидат фармацевтических наук, младший научный сотрудник департамента науки и подготовки научно-педагогических кадров Санкт-Петербургского государственного химико-фармацевтического университета


История успеха
Больше возможностей
  • Усовершенствованное средство для лечения пациентов с хроническим остеомиелитом
  • Дрожжи для создания первого в России ветеринарного препарата на основе гамма-интерферона собаки
Слушать подкаст
Ученые СПбГУ отвечают на важные вопросы
Научно-популярные новости СПбГУ, исследования, видеолекции, интервью с учеными Университета
Ландау позвонит
Оставить заявку
Укажите контактную информацию, мы вам перезвоним и ответим на интересующие вопросы
Наши эксперты готовы ответить на ваши вопросы
Получить консультацию
Подписывайтесь на наши соцсети
Подпишитесь на соцсети СПбГУ, чтобы быть в курсе актуальных новостей
Простым языком об исследованиях и разработках ученых СПбГУ
Журнал «Санкт-Петербургский университет»