Метагеномика
Биоинформатика
05.09.25
«Работа ученых СПбГУ очень важна для российской медицины»

Алексей Геннадьевич Куляш
ЭКСПЕРТ
заведующий лабораторией молекулярно-генетических исследований Клиники высоких медицинских технологий имени Н. И. Пирогова СПбГУ
В последние пять лет вышло огромное количество научных публикаций, подчеркивающих важность изменений кишечной флоры у людей в критическом состоянии (например, при развитии сепсиса). Это поспособствовало развитию методов, направленных на анализ микробиоты, в том числе метагеномного секвенирования.
К сожалению, сегодня этот и подобные диагностические исследования имеют ряд недостатков, которые ограничивают их применение. В том числе это высокая стоимость оборудования и реактивов, необходимость создания отдельных лабораторий, сложность технологического и программного обеспечения для постобработки «сырых» сведений, необходимость поддержания высокой интенсивности исследований для оптимизации рабочих процессов и многое другое.

Программный продукт и идеологический подход группы разработчиков Antimicro, которая обрабатывает данные метагеномного секвенирования, безусловно, приближают практическое здравоохранение к возможности широкого применения таких методов исследования. Особенно в условиях, когда организация одновременной микробиологической и ПЦР-диагностики в пределах одного подразделения в непрерывном режиме доступна в единичных лечебных учреждениях страны.

Разработка исследователей Университета будет полезна для врачей, чьи пациенты входят в группу высокого риска развития неблагоприятных исходов, а также для специалистов отделений реанимации и интенсивной терапии. Конечно, в ряде тяжелых ситуаций на проведение метагеномного секвенирования просто может не хватать времени. В таких случаях требуется экстренное лечение, поэтому его рациональнее назначить и начать без проведения секвенирования. Когда же время позволяет, метагеномный анализ может помочь установить более точный характер поражения и составить полное представление о патологическом процессе. Удобная программа с понятным интерфейсом, такая как Antimicro, поможет сделать это быстро.

Считаю, что работа ученых СПбГУ очень важна для российской медицины. Создание программы Antimicro должно подстегнуть специалистов смежных специальностей к разработкам технологий для обеспечения доступности и удобства диагностических инструментов, необходимых клиницистам.

Екатерина Заикина
Подготовила
Слушать подкаст
Ученые СПбГУ отвечают на важные вопросы
Научно-популярные новости СПбГУ, исследования, видеолекции, интервью с учеными Университета
Ландау позвонит
Оставить заявку
Укажите контактную информацию, мы вам перезвоним и ответим на интересующие вопросы
Наши эксперты готовы ответить на ваши вопросы
Получить консультацию
Подписывайтесь на наши соцсети
Подпишитесь на соцсети СПбГУ, чтобы быть в курсе актуальных новостей
Простым языком об исследованиях и разработках ученых СПбГУ
Журнал «Санкт-Петербургский университет»